macOS Server（現在はスタンドアロンサービスとしてmacOSに統合）の一部であるプロファイルマネージャは、IT管理者がmacOS、iOS、iPadOSデバイスの構成プロファイルを作成、編集、配布するためのツールです。これらのプロファイルは、MDM経由または手動で展開できる設定と制限を定義します。Apple Configurator（オプションA）は、主にiOS/iPadOS/tvOSデバイスの監視と構成を目的としており、macOSのプロファイル作成には使用されません。システム環境設定（オプションC）はユーザー向けの設定アプリであり、プロファイル作成ツールではありません。ターミナル（オプションD）はスクリプト作成に使用できますが、プロファイル作成用ではありません。Apple Platform Deployment Guideでは、プロファイル作成のためのmacOSツールとしてプロファイルマネージャが挙げられています。

組織IDは購入をリンクします。Apple Business Managerユーザーガイドには、「デバイスがApple Business Managerアカウントに割り当てられるように、販売店に組織IDを提供してください」と記載されています。参考資料：
Apple Business Manager ユーザーガイドの「デバイスの購入」セクション。
Apple プラットフォーム導入ガイドの「デバイスの割り当て」セクション。

開発者の割り当てが必要です。Apple Business Managerユーザーガイドには、「カスタムアプリを配布するには、アプリ開発者がアプリを組織のApple Business Manager IDに割り当てる必要があります」と記載されています。参考資料：
Apple Business Manager ユーザーガイドの「カスタム アプリ」セクション。
Apple プラットフォーム導入ガイドの「アプリの配布」セクション。

BYOD向けに設計されたユーザー登録では、デバイス上の個人データと管理対象データを分離するために、管理対象Apple IDが必要です。管理対象Apple IDは、個人のプライバシーを保護しながら、組織のポリシーに基づいてユーザーを認証します。自動デバイス登録（オプションA）とデバイス登録（オプションB）は組織所有のデバイスを対象としており、管理対象Apple IDは必須ではありませんが、オプションで使用できます。Appleプラットフォーム導入ガイドでは、ユーザー登録の機能には管理対象Apple IDが必要であると明記されています。
参考:Apple プラットフォーム導入ガイド (章: ユーザー登録)。

構成プロファイルを使用すると、IT管理者はデバイスの通知設定を管理できます。例えば、特定のアプリの通知を無効にしたり、おやすみモードを設定したり、通知センターへのアクセスを制限したりできます。これらのプロファイルはMDM経由または手動で展開できます。「探す」（オプションB）とiCloud（オプションC）は通知管理とは関係ありません。MDM（オプションD）はプロファイルを提供しますが、設定はプロファイルに含まれています。プロファイルによる通知制御の詳細については、「Appleプラットフォーム導入ガイド」をご覧ください。
参考:Apple プラットフォーム導入ガイド (章: 構成プロファイル)。