アカウント駆動型のユーザー登録はMDMの適用範囲を制限します。iOS導入リファレンスには、「MDMはユーザー登録でパスコードの要求などのポリシーを適用できますが、位置情報へのアクセス、デバイスのデータ消去、アクティベーションロックの無効化はできません」と記載されています。参考資料：
iOS 展開リファレンスの「ユーザー登録」セクション。
Apple プラットフォーム導入ガイドの「BYOD 管理」セクション。

コンテンツトークンは、アプリのライセンスをMDMにリンクして配布します。Apple Business Managerユーザーガイドには、「マネージドディストリビューションを設定するには、Apple Business Managerからコンテンツトークンをダウンロードし、MDMサーバーにアップロードしてください。このトークンにより、MDMは登録済みデバイスにアプリを管理および配布できるようになります。」と記載されています。オプションB、C、Dはアプリの配布とは無関係です。
参照：
Apple Business Manager ユーザーガイドの「アプリとブック」セクション。
モバイル デバイス管理プロトコル リファレンスの「アプリ管理」セクション。

macOS構成プロファイルをデバイスに展開するには、MDMソリューションが必要です。MDMは、APNs経由で登録済みデバイスにリモートでプロファイルをプッシュし、一元管理を実現します。Apple Developerアカウント（オプションA）はアプリ開発用であり、プロファイルの展開には使用しません。ユーザーの承認（オプションC）は手動インストールには必要ですが、MDM展開、特に監視対象デバイスでは必要ありません。VPN構成（オプションD）は関係ありません。Apple Platform Deployment Guideでは、MDMがmacOSデバイスへのプロファイル展開の標準的な方法として指定されています。
参考:Apple プラットフォーム導入ガイド (章: 構成プロファイル)。

組織IDは購入をリンクします。Apple Business Managerユーザーガイドには、「デバイスがApple Business Managerアカウントに割り当てられるように、販売店に組織IDを提供してください」と記載されています。参考資料：
Apple Business Manager ユーザーガイドの「デバイスの購入」セクション。
Apple プラットフォーム導入ガイドの「デバイスの割り当て」セクション。

Apple School Manager (ASM) では、「App とブック」セクションからブックを購入するには管理者の役割が必要です。管理者の役割には、財務取引とコンテンツ取得の管理権限があるためです。コンテンツマネージャなどの他の役割は、ブックの配信はできますが、購入はできません。Apple Developer アカウント（オプション B）はアプリ用であり、ブック用ではありません。管理対象 Apple ID（オプション C）はユーザー用であり、購入用ではありません。ユーザーの承認（オプション D）は関係ありません。Apple School Manager ユーザーガイドで、管理者の購入権限を確認してください。