Apple Configurator for Macは起動の問題を解決します。Apple Configuratorユーザーガイドには、「iPadがAppleロゴ画面で停止した場合は、Apple Configuratorを実行しているMacに接続して完全な復元を実行してください」と記載されています。オプションAは存在せず、オプションBとオプションCはこの問題に直接対処しません。
参考文献:
Apple Configurator ユーザーガイドの「デバイスの復元」セクション。
Apple プラットフォーム導入ガイドの「デバイスのトラブルシューティング」セクション。

組織IDは購入をリンクします。Apple Business Managerユーザガイドには、「デバイスがApple Business Managerアカウントに割り当てられるように、販売店に組織IDを提供してください」と記載されています。参考：
Apple Business Manager ユーザーガイドの「デバイスの購入」セクション。
Apple プラットフォーム導入ガイドの「デバイスの割り当て」セクション。

Apple Silicon搭載Macでは、ファームウェアパスワードに代わる新しいセキュリティモデルであるSetRecoveryLockMDMコマンドが導入されました。このコマンドを使用すると、管理者はmacOS Recoveryを起動する前に入力しなければならないリカバリパスワードを設定できます。起動セキュリティユーティリティはRecoveryからアクセスするため、Recovery LockはエンドユーザーがIT部門の許可なくこのツールにアクセスできないように効果的に防止します。Appleの学習資料では、SetFirmwarePasswordなどの従来のコマンドはIntelベースのMacにのみ適用されることが明記されています。FileVaultは保存データを保護しますが、Recoveryへのアクセスはブロックしません。
PreventSystemSecurityAccess は定義済みのMDMコマンドではありません。正しい最新のアプローチは、Apple Siliconのセキュアブートアーキテクチャとエンタープライズ展開のベストプラクティスに準拠したSetRecoveryLockです。
参考資料:Apple プラットフォーム展開 - 「Apple Silicon Mac でリカバリ ロックを使用する」

AppleはUser Enrollmentを通じて、組織データと個人データを暗号化コンテナで分離するプライバシー重視の管理モデルを提供しています。Apple Learningによると、ユーザーが個人のiPhoneを登録すると、カレンダー、メール、メモなどのアプリは管理対象アカウントごとに個別のデータサイロを作成します。これにより、例えば、企業の会議招待は管理対象カレンダーに保持され、個人カレンダーにコピーできなくなります。同様に、個人カレンダーのイベントはプライベートに保持され、MDM制御の影響を受けません。Safariデータ、ブックマーク、閲覧履歴は個人情報のままであり、暗号化によって分離されません。連絡先も、管理対象アカウントに明確に紐付けられていない限り、普遍的に分離されません。暗号化による保証はカレンダーに最も明確に適用され、コンプライアンスの確保とユーザーのプライバシー保護を同時に実現します。
参考資料:Apple プラットフォームの展開 - 「ユーザー登録とデータの分離」

監視対象デバイスでは、変換はシームレスに行われます。モバイルデバイス管理プロトコルリファレンスには、次のように記載されています。
「監視対象デバイスでは、MDM は管理対象バージョンを展開する際に、ユーザーの介入なしに管理対象外アプリを管理対象に変換できます。」参考資料:
モバイル デバイス管理プロトコル リファレンスの「アプリ管理」セクション。
iOS 展開リファレンスの「管理対象アプリ」セクション。